Bioperl une extension Perl pour la bioinformatique.
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Bioperl Classement & Résumé

Bioperl Mots clés

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Bioperl La description

Une extension Perl pour la bioinformatique. BIOPERL Project est une collection de modules PERL facilitant le développement de scripts PERL pour les applications bioinformatiques. En tant que tel, il n'inclut pas les programmes prêts à utiliser dans le sens où de nombreux forfaits commerciaux et des interfaces Web gratuites de Web (par exemple, l'ENTREZ, SRS) .Inez l'autre main, BIOPERL fournit des modules perl réutilisables qui facilitent l'écriture de scripts PERL pour la séquence. Manipulation, accès des bases de données à l'aide d'une gamme de formats de données et d'exécution et d'analyse des résultats de divers programmes de biologie moléculaire, y compris BLAST, Clustalw, TCOFFEE, Genscan, EstScan et HMMER. En conséquence, BIOPERL permet de développer des scripts pouvant analyser de grandes quantités de données de séquence de manière généralement difficile ou impossible avec des systèmes Web. À l'ordre de tirer parti de Bioperl, l'utilisateur a besoin d'une compréhension de base du langage de programmation PERL, y compris une compréhension de Comment utiliser perl références, modules, objets et méthodes. Si ces concepts sont inconnus, l'utilisateur est renvoyé à l'un des différents livres d'introduction ou intermédiaires sur Perl.Nous avons aimé la langue Perl Core de S. Holzmer, la presse technologique de Coriolis, par exemple. Ce didacticiel n'est pas destiné à enseigner aux fondamentaux de Perl à ceux qui ont peu ou pas d'expérience dans la langue Perl. D'autre part, des connaissances avancées de Perl - telles que comment écrire un module PERL orienté objet - n'est pas nécessaire pour réussir à utiliser BIOPERL.BIOPERL est un logiciel open source qui est toujours en cours de développement actif. Les avantages du logiciel open source sont bien connus. Ils incluent la possibilité d'examiner et de modifier librement le code source et l'exemption des frais de licence de logiciels.Cever, car le logiciel Open Source est généralement développé par un grand nombre de programmeurs de bénévoles, le code résultant n'est souvent pas aussi clairement organisé et son interface utilisateur pas comme Normalisé comme dans un produit commercial mature.En addition, dans tout projet de développement actif, la documentation peut ne pas suivre le développement de nouvelles fonctionnalités. Par conséquent, la courbe d'apprentissage pour un logiciel source activement développé et open source est parfois rare. Exigences: · Perl Quoi de neuf dans cette version: · Il s'agit de la première version de base de la série 1.6 et de la première version stable après 5 ans de communiqués de développement.

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