Bio :: Affymetrix :: CDF BIO :: affamétrix :: CDF est un module Perl pour analyser les fichiers CDF Affymetrix.
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Bio :: Affymetrix :: CDF Classement & Résumé

Bio :: Affymetrix :: CDF Mots clés

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Bio :: Affymetrix :: CDF La description

Bio :: Affymetrix :: CDF est un module Perl pour analyser les fichiers CDF Affymetrix. Bio :: Affymetrix :: CDF est un module Perl pour analyser les fichiers CDF d'affectation de CDF.Synopsisuse Bio :: Affymetrix :: CDF; # parse the CDF FileMy $ CDF = Nouvelle Bio :: affymetrix :: CDF ({"Probemode" => 0 }); $ CDF-> parse_from_file ("foo.cdf"); # trouver des faits amusants sur ce type de puceprint $ CDF-> rangées (). "," $ CDF-> cols (). "N"; $ CDF-> Version (). "N"; # Imprimez tous les noms de probeset sur cette puce TypeForeach My $ i (Keys% {$ CHP-> Probèsets}) {Print $ CHP-> Problèmes -> {$ i } -> Nom (). "N"; } Le système Microarray Affymetrix produit des fichiers dans une variété de formats. Si cela ne signifie rien pour vous, ces modules ne sont probablement pas pour vous :). Ce module analyse des fichiers CDF. Utilisez ce module si vous souhaitez découvrir la conception d'une affamée Genechip ou si vous avez besoin de l'objet pour un autre des modules de ce package.Tous des modules Bio :: Affymetrix Analysez un fichier entièrement en mémoire. Vous avez donc besoin d'assez de mémoire pour conserver ces objets. Pour certaines applications, l'analyse d'un flux peut être plus appropriée, espérons que la source de ces modules donnera suffisamment d'indices pour faire une tâche facile. Ce module en particulier prend beaucoup de mémoire si les informations de la sonde sont également stockées (environ 150 Mo). L'utilisation de la mémoire n'est pas trop enfoncée (environ 15 Mo) si les informations de niveau de la sonde sont omises. Vous pouvez peut-être.Control ceci en réglant probemode => 1 ou probemode => 0 dans le constructeur.Vous pouvez également utiliser ces modules pour écrire des fichiers CDF (à l'aide de la méthode Write_To_Filehandle). Voir la compatibilité pour des mises en garde importantes. Exigences: · Perl

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