BIO :: SEQ :: SeqwithQuality BIO :: SEQ :: Seqwithquality est un objet Bioperl emballage d'une séquence avec sa qualité.
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BIO :: SEQ :: SeqwithQuality Classement & Résumé

BIO :: SEQ :: SeqwithQuality Mots clés

Module Perl objet séquence bioperl Objet Bioperl conditionnement de séquence

BIO :: SEQ :: SeqwithQuality La description

BIO :: SEQ :: SeqwithQuality est un objet Bioperl emballant une séquence avec sa qualité. BIO :: Seq :: SeqwithQuality est un objet Bioperl Emballage d'une séquence avec sa qualité.Synopsis Utilisez Bio :: PrimaireSeq; utiliser bio :: SEQ :: primairequal; # faire de la mémoire ma mémoire mad $ urbain :: SEQ :: Seqwithquality-> Nouveau (-Qual => '1020304050502010 ', -Seq =>' ATCGATCG ', -ID =>' human_id ', -accession_number => 'al000012',); # Faire des objets # d'abord, faire un objet primaireQ My $ SEQOBJ = BIO :: primaireSeq-> nouveau (-Seq => 'ATCGATCG', -Id => 'Genefragment-12', -ACCession_Number => 'x78121', alphabet => 'ADN'); # Maintenant, faites un objet primaire My $ Qualobj = Bio :: SQ :: SEQ :: PRICARQUAL-> Nouveau (-Qual => '1020304050502010 ', -Id =>' Genefragment-12 ', -ACCession_Number => 'X78121', -alphabet => 'ADN'); # Maintenant faire l'objet Seqwithquality My $ SWQOBJ = BIO :: SQ :: SEQWIHQuality-> Nouveau (-Seq => $ Seqobj, -Qual => $ Qualobj); # Fini! $ swqobj-> id (); # L'identifiant de l'objet SEQWIHQULALITY # peut ne pas correspondre à l'ID de la séquence ou du numéro de la qualité (vérifier la pod, Luke) $ SWQOBJ-> SEQ (); # la séquence de l'objet Seqwithquality $ SWQOBJ-> Qual (); # la qualité de l'objet SEQWIHQULALITY # pour sortir des parties de la séquence. Imprimer "séquence", $ SEQOBJ-> ID (), "avec adhésion", $ seqobj-> adhésion, "et desc", $ seqobj-> desc, "n"; $ string2 = $ seqobj-> subseq (1,40); Exigences: · Perl

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